Die Niederelbebahn verändert wegen des Ausbaus zur S-Bahn-Strecke im Bereich Stade-Neugraben derzeit vielfach ihr Aussehen. Im Augenblick werden in den Stationen Dollern und Agathenburg die Bahnsteige für den S-Bahn-Verkehr umgebaut. Sie sollen dabei dem S-Bahn-Standard entsprechend angepasst werden. Der Bahnhof Neu Wulmstorf – oder besser: das Areal, auf dem er einst stand – ist momentan eine riesige Baugrube. Das kleine Empfangsgebäude nebst Güterschuppen wurde bereits im Februar abgerissen. An selber Stelle entsteht zurzeit die Unterführung, die in Zukunft den beschrankten Bahnübergang ablösen soll.
Außerdem wird eine Fußgängerunterführung errichtet. Der Bahnverkehr läuft im Augenblick über Hilfsbrücken, unter denen die Bauarbeiten bei laufendem Betrieb stattfinden. Im Augenblick werden noch die bisherigen Bahnsteige genutzt. Nach Abschluss der Bauarbeiten für die Unterführungen entstehen im Bereich der heutigen Ladestraße neue Bahnsteige. In unmittelbarer Nähe wird dann auch ein Busbahnhof errichtet. Die Bauarbeiten werden sich – wie berichtet – bis ins kommende Jahr hinziehen.
Im Zusammenhang mit den Arbeiten gab es am 24. Juli in Neu Wulmstorf einen kleineren Zwischenfall: Das Schotterbett unter dem Gleis 2 war im Bereich der Hilfsbrücken auf einer Länge von 3 bis 4 Metern abgesackt. Da zwischen Buxtehude und Neugraben so nur ein Gleis zur Verfügung stand, kam es zu erheblichen Verspätungen von bis zu einer Stunde.
Auch die Station Horneburg hat ihr Aussehen völlig verändert. Das Ausweichgleis am Hausbahnsteig wurde Mitte Juli abgebaut, die anderen beiden Streckengleise im Bahnhofsbereich erneuert. Der Mittelbahnsteig ist Vergangenheit, stattdessen verfügt Horneburg inzwischen über Außenbahnsteige.
Relativ weit fortgeschritten ist der Umbau des Bahnhofs Neugraben, hier stehen im wesentlichen nur noch Restarbeiten an. Die Systemwechselstelle ist funktionstüchtig hergestellt und bereits in zumeist nächtlichen Testfahrten erprobt worden. Das Gleisfeld der Abstellanlage wurde erheblich umgestaltet, die Abstellgleise werden vom S-Bahn-Streckengleis nunmehr eingeschlossen. Die Züge nach Stade / Cuxhaven / Harburg halten jetzt nur noch auf den Gleisen 4 und 5. Alle übrigen Gleise sind für die S-Bahn vorgesehen, die Oberleitung über Gleis 3 wurde dementsprechend demontiert.
Gestalt nimmt auch die neue Station Fischbek an, für deren Bau erhebliche Erdmassen bewegt wurden. Auch hier entsteht eine Unterführung. Das unmittelbar neben dem zukünftigen Haltepunkt gelegene Anschlussgleis zur Fischbeker Kaserne, das seit einigen Jahren wegen deren Stillegung ungenutzt war, wurde aufgelassen und die Anschlussweiche ausgebaut.
Fast fertig sind unterdessen die Park & Ride-Anlagen an den künftigen S-Bahn-Haltestellen Buxtehude und Neukloster. Die Stadtwerke Buxtehude haben insgesamt 315 Stellplätze geschaffen. Die Inbetriebnahme ist allerdings erst für Dezember vorgesehen.